CRISPR maymun çiçeği için daha hızlı test yapılmasını sağlar

ROCKVILLE, MD. – Eskiden maymun çiçeği olarak bilinen çiçek hastalığı, insanlar arasında fiziksel temas yoluyla yayılan nadir bir viral hastalıktır. Şu anda mpox testi laboratuvar ekipmanı gerektirir ve test sonuçlarının alınması birkaç saat sürebilir. Ancak yeni araştırmalar, yakında herhangi bir klinikte yapılabilecek daha hızlı bir test yapmanın bir yolunu gösteriyor.

Penn State Üniversitesi'nde Weihua Guan'ın danışmanlığını yaptığı yüksek lisans öğrencisi Dr. Ahsan Ahmad, bu araştırmayı konferansta sunacak Biyofizik Derneğinin Altmış Sekizinci Yıllık Toplantısı10-14 Şubat 2024'te Philadelphia, Pensilvanya'da gerçekleşmesi planlanıyor.

Çiçek hastalığının semptomları genellikle ateş, döküntü ve şişmiş lenf düğümleri gibi hafif olsa da, ciddi vakalar ortaya çıkabilir ve tıbbi müdahale gerektirebilir. Hastalık bulaşıcı olduğundan test yapmak önemlidir, böylece hastalığı olan kişiler semptomlar ortadan kalkana veya uygun tıbbi bakım alana kadar kendilerini izole edebilirler.

Daha hızlı bir test geliştirmek için araştırmacılar, Nobel Ödüllü gen düzenleme teknolojisi olan CRISPR'ı kullandılar. 2017'den beri bilim insanları CRISPR uygulamasını gen düzenlemeden moleküler teşhis tekniklerine kadar genişletti.

Bu çalışmada Ahmed, özellikle çiçek hastalığı virüsünü hedeflemek için bir muhabirle birleştirilmiş bir genetik dizi oluşturdu. Programlanabilir CRISPR RNA daha sonra hem hedefe hem de Cas12a adı verilen bir proteine ​​bağlanır ve birlikte CRISPR/Cas12a, farklı boyutlarda parçalar oluşturmak için raportörü böler. Araştırmacılar daha sonra bu raporlayıcıların parçalarını analiz etmek için nano-gözenek algılama teknolojisini kullanabilir ve örnekte MOBOX'un mevcut olup olmadığını tespit eden hızlı ve doğru bir test sağlayabilir.

Ekip, oluşturdukları testin çiçek hastalığına özel olduğunu doğruladı ve çiçek hastalığı virüsünün yakın akrabası olan sığır çiçeği virüsü örneklerini test ettiklerinde testin olumlu bir sonuç göstermediğini doğruladı.

Ahmed, tüm sürecin hızlı olduğunu söyledi: “Viral yüke bağlı olarak hedefi tespit etmek toplamda 32 ila 55 dakika sürüyor.” Bu şu anda PCR yöntemini kullanarak çiçek hastalığını laboratuvarda test etmek için gerekenden çok daha hızlı.

Araştırmacılar, bu nanogözenek teknolojisini diğer patojenlere yönelik testler oluşturmak için uygulamayı planlıyor ve böylece tek bir numunenin, taşınabilir bir cihaz kullanılarak birden fazla hedef için test edilmesine olanak tanıyor. Bu teknoloji şu anda ticari olarak mevcut olmasa da Ahmed, yakında bu tür patojen testlerini yaygın olarak kullanılabilir hale getirebilecek bir cihaz yaratacaklarını umuyor.