Grip tanısı ve takibi basit bir testle destekleniyor

Her yıl gribe yakalananların yüzde birinden azı teste tabi tutuluyor, bunun nedeni çoğu testin eğitimli personel ve pahalı ekipman gerektirmesi. Araştırmacılar artık daha fazla hastanın ne tür gribe yakalandığını bilmesine ve uygun tedaviyi almasına olanak tanıyabilecek düşük maliyetli bir kağıt testi geliştirdi.

Massachusetts Teknoloji Enstitüsü Broad Enstitüsü ile Harvard ve Princeton üniversitelerinden bir ekip tarafından ve ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinin desteğiyle geliştirilen test, mevsimsel gribin iki ana türünü ayırt etmek için CRISPR teknolojisini kullanıyor: influenza A ve B’nin yanı sıra mevsimsel influenza alt tipleri H1N1 ve H3N2. Ayrıca antiviral tedaviye dirençli suşları da tanımlayabiliyor ve daha fazla çalışmayla, şu anda çiftlik hayvanlarını enfekte eden H5N1 virüsü de dahil olmak üzere domuz ve kuş gribi türlerini tespit edebiliyor.

Molecular Diagnostics dergisinde yer alan bulgular, Amerika Birleşik Devletleri ve diğer ülkelerdeki doktor muayenehanelerine ve laboratuvarlara doğru, düşük maliyetli ve hızlı testler getirerek salgına müdahale ve klinik bakımın iyileştirilmesine yardımcı olabilir.

Eşbaşkan yazar Cameron Myhrvold, “Sonuçta, bu testlerin hızlı antijen testleri kadar basit olacağını ve tipik olarak laboratuvar ortamında gerçekleştirilen bir nükleik asit testinin özgüllüğüne ve performansına sahip olacağını umuyoruz” dedi. Broad Institute üyesi ve Harvard Üniversitesi ve Harvard T.H Chan Halk Sağlığı Okulu’nda profesör ve Howard Hughes Tıp Enstitüsü’nde araştırmacı olan Pardis Sabeti ile yapılan çalışmada. Şu anda Princeton Üniversitesi’nde yardımcı doçent olan Myhrvold, çalışma başladığında Sabetti’nin laboratuvarında doktora sonrası araştırmacı olarak çalışıyordu.

Vurgulamak

Test, Sabeti’nin laboratuvarının 2020’de geliştirdiği ve örneklerdeki belirli viral RNA dizilerini tanımlamak için CRISPR enzimlerini kullanan SHINE adlı teknolojiye dayanıyor. Araştırmacılar SHINE’ı ilk önce SARS-CoV-2 virüsünü test etmek, ardından Delta ve Omicron varyantları arasında ayrım yapmak için kullandılar. Daha sonra 2022’de testi, yaygın olduğunu her zaman bildikleri diğer virüsleri (grip) tespit edecek şekilde değiştirmeye başladılar. Pahalı ekipmanlara sahip hastaneler veya teşhis laboratuvarları yerine sahada veya kliniklerde kullanılabilecek testler oluşturmak istediler.

Harvard Tıp Fakültesi’nde tıp öğrencisi olan çalışmanın ortak yazarı Bin Zhang, “Pahalı floresan makineler yerine kağıt bant okumanın kullanılması, yalnızca klinik bakım açısından değil, aynı zamanda epidemiyolojik gözetim açısından da büyük bir ilerlemedir” dedi. ve çalışma başladığında Sabetti’nin laboratuvarında bir üniversite araştırmacısı.

Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) gibi tipik teşhis yöntemleri uzun işlem süreleri, eğitimli personel, özel ekipman ve reaktifleri -80°C’de saklamak için dondurucular gerektirirken, SHINE oda sıcaklığında yaklaşık 90 dakika içinde gerçekleştirilebilir. Şu anda test, reaksiyonu ısıtmak için yalnızca ucuz bir termal kütle gerektiriyor ve araştırmacılar, 15 dakika içinde sonuç alma hedefiyle süreci basitleştirmeye çalışıyor.

Araştırmacılar ayrıca farklı grip türlerini ayırt etmek için SHINE’ı da değiştirdiler. Gelecekte testin, grip ve SARS-CoV-2 gibi benzer semptomlara sahip iki farklı virüsü tespit edecek şekilde uyarlanabileceğini söylüyorlar.

Sabetti’nin laboratuvarında doktora sonrası araştırmacı ve çalışmanın ilk yazarlarından John Arizte-Sanz, “Bir hastayı etkileyen grip türünü veya alt tipini izole edebilmenin, tedavileri ve halk sağlığı müdahaleleri üzerinde etkileri vardır” dedi.

Arizte-Sanz, örneğin testlerin doktorların yalnızca bazı türler için etkili olan yaygın bir antiviral olan oseltamivir kullanıp kullanmayacağına karar vermelerine yardımcı olabileceğini ekledi. Sahada hızlı testler, bilim adamlarının bir salgın sırasında virüsün nasıl yayıldığını daha iyi izlemek için örnekleri daha stratejik bir şekilde toplamasına da yardımcı olabilir.

Daha sonra araştırmacılar, kuş ve domuz gribi türlerini test etmek için Shine’ın sistemini değiştiriyor. Arizte-Sanz, “SARS-CoV-2 ve şimdi de griple, SHINE’ı yeni veya gelişen virüsleri tespit edecek şekilde kolayca uyarlayabileceğimizi gösterdik” dedi. “Bunu H5N1’e uygulamaktan heyecan duyuyoruz.”